Законны ли действия руководителя по увольнению заместителя руководителя в связи с истечением срока действия договора?

Здравствуйте! Сложилась такая ситуация: заместителя руководителя взяли по срочному трудовому договору сроком на 1 год, на тот момент учредителем нашей организации была организация ГУ. В течение года нас переподчинили к другой организации, наш руководитель, согласно Устава, не продлил заместителю руководителя договор и уволил. На что тот заявляет в суд с тем, что его брали ГУ и никаких дополнительных соглашений не было, поэтому его уволили незаконно. Законны ли действия руководителя по увольнению заместителя руководителя в связи с истечением срока действия договора?