Наложение выплат начальством на работника

Работала в кафе кассиром 2 месяца, под конец лета в организации накопилась недостача, так как многие работники поуходили, недостачу стали вешать на меня, плюс была система скидок питания на персонал, работала в ночь, делала их много, но и дневные работники делали по-больше меня, за месяц накопилась круглая сумма, начальство, поняв, что понесли убытки, введя систему скидок, начало обвинять персонал в воровстве. Но так как и старых работников оказалась только я, все это скинули на меня, мол, возвращать. Грозятся, если уйду с работы, подать в прокуратуру. Получается на мне крупная сумма плюс недостачу такую же повесили.

Но дело в том, что я при приеме на работу, как и многие из работающих здесь, подписала лишь договор о стажировке и приносила только ксерокс паспорта. Больше никаких документов, вроде снилса, инн и трудовой с меня не требовали и в лицо говорили, что я неофициально оформлена. Но сейчас стали говорить, мол," ты официально оформленный работник, не вздумай уйти", хотя никаких доп документов я не приносила.

Подскажите, как я могу себя защитить в этой ситуации, грозит ли мне иск в суде, и, возможно, ли подать встречную жалобу, например, в федеральную службу по труду и занятости за то, что они неправильно оформляют на работу и понесет ли при этом организация штрафы?