При подаче документов в ФМС угрожают санкциями из-за просроченной миграционной карты

Добрый день! Ситуация сложилась следующая.

Я гражданин Украины, проживал на территории РФ и пробыл вместо положенных 3 месяцев фактически почти 2 года с 2012 по 2014. В июле 2014 я выехал через пограничный пункт с этой просроченной миграционкой, выпустили меня после беседы и уточнения причин почему получилась просрочка. Никаких официальных документов (протоколов и т.п не составлялось). Теперь я снова въехал на территорию РФ, зарегистрировался, но при подаче документов в ФМС на временное пребывание они увидели, что была просрочка и грозятся теперь санкциями вплоть до выдворения.

Хочу спросить, если я выехал и въехал на территорию РФ легально, и сейчас нахожусь здесь официально, могут ли они выдворить меня и правомочны ли их действия?

Спасибо.